MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 2251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CGA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
2	NC_007427	TCG	2	6	211	216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
3	NC_007427	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
4	NC_007427	CCG	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
5	NC_007427	GCT	2	6	372	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
6	NC_007427	ACG	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
7	NC_007427	GCC	2	6	459	464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
8	NC_007427	CTCA	2	8	485	492	25 %	25 %	0 %	50 %	76803368
9	NC_007427	ACC	2	6	549	554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803368
10	NC_007427	TTC	2	6	598	603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803368
11	NC_007427	CA	3	6	650	655	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
12	NC_007427	CCG	2	6	718	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
13	NC_007427	CT	3	6	734	739	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
14	NC_007427	TC	3	6	746	751	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
15	NC_007427	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
16	NC_007427	GAC	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
17	NC_007427	GTC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
18	NC_007427	GAC	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
19	NC_007427	GAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
20	NC_007427	TCA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
21	NC_007427	AGA	2	6	1028	1033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
22	NC_007427	GGC	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
23	NC_007427	CGG	2	6	1140	1145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
24	NC_007427	AGGA	2	8	1279	1286	50 %	0 %	50 %	0 %	76803368
25	NC_007427	TCC	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803368
26	NC_007427	CAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
27	NC_007427	CGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
28	NC_007427	CGAC	2	8	1368	1375	25 %	0 %	25 %	50 %	76803368
29	NC_007427	CGAC	2	8	1445	1452	25 %	0 %	25 %	50 %	76803369
30	NC_007427	T	6	6	1453	1458	0 %	100 %	0 %	0 %	76803369
31	NC_007427	TGG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803369
32	NC_007427	CGA	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803369
33	NC_007427	TCG	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803369
34	NC_007427	GTT	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
35	NC_007427	TGAA	2	8	1830	1837	50 %	25 %	25 %	0 %	76803370
36	NC_007427	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
37	NC_007427	CAG	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803370
38	NC_007427	TTC	2	6	1994	1999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803370
39	NC_007427	TAC	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
40	NC_007427	ATC	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
41	NC_007427	TGT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
42	NC_007427	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
43	NC_007427	CAA	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803370
44	NC_007427	CCG	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803370
45	NC_007427	CTC	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803370
46	NC_007427	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803370
47	NC_007427	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803371
48	NC_007427	ATC	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
49	NC_007427	GTC	2	6	3279	3284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803371
50	NC_007427	AAG	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
51	NC_007427	GAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
52	NC_007427	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
53	NC_007427	CAG	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
54	NC_007427	GCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
55	NC_007427	AGCGGA	2	12	3490	3501	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803371
56	NC_007427	GA	3	6	3568	3573	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
57	NC_007427	TCA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
58	NC_007427	CGA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
59	NC_007427	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803371
60	NC_007427	C	6	6	3782	3787	0 %	0 %	0 %	100 %	76803371
61	NC_007427	CAG	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
62	NC_007427	GAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
63	NC_007427	TCT	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803371
64	NC_007427	TC	3	6	4513	4518	0 %	50 %	0 %	50 %	76803372
65	NC_007427	CTC	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803372
66	NC_007427	CTC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803373
67	NC_007427	TCG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
68	NC_007427	CGC	2	6	4751	4756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803373
69	NC_007427	CGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
70	NC_007427	GCG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803373
71	NC_007427	TCG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
72	NC_007427	CGT	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
73	NC_007427	GT	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	76803373
74	NC_007427	GTA	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803373
75	NC_007427	ACG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
76	NC_007427	CGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
77	NC_007427	GCCG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	76803373
78	NC_007427	TCG	3	9	5237	5245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
79	NC_007427	CCG	2	6	5259	5264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
80	NC_007427	CGT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
81	NC_007427	GTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
82	NC_007427	GTA	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803374
83	NC_007427	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
84	NC_007427	TCCG	2	8	5495	5502	0 %	25 %	25 %	50 %	76803374
85	NC_007427	CGA	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803374
86	NC_007427	CCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
87	NC_007427	TCG	2	6	5582	5587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
88	NC_007427	GCTG	2	8	5731	5738	0 %	25 %	50 %	25 %	76803375
89	NC_007427	TCG	3	9	5804	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
90	NC_007427	TCG	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
91	NC_007427	TCG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
92	NC_007427	CTC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803376
93	NC_007427	GTG	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803376
94	NC_007427	GTC	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
95	NC_007427	GA	3	6	6263	6268	50 %	0 %	50 %	0 %	76803376
96	NC_007427	CGTC	2	8	6282	6289	0 %	25 %	25 %	50 %	76803376
97	NC_007427	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
98	NC_007427	GTC	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
99	NC_007427	TCCGC	2	10	6378	6387	0 %	20 %	20 %	60 %	76803376
100	NC_007427	GTC	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
101	NC_007427	TCG	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
102	NC_007427	TGAA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	25 %	0 %	76803377
103	NC_007427	GAC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
104	NC_007427	TTC	2	6	6789	6794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803377
105	NC_007427	CGA	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
106	NC_007427	C	6	6	7222	7227	0 %	0 %	0 %	100 %	76803378
107	NC_007427	GCTG	2	8	7248	7255	0 %	25 %	50 %	25 %	76803378
108	NC_007427	GCT	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
109	NC_007427	TGA	3	9	7308	7316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803378
110	NC_007427	GAA	2	6	7339	7344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803378
111	NC_007427	CCAGAA	2	12	7351	7362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76803378
112	NC_007427	GAT	3	9	7408	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803378
113	NC_007427	GAC	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
114	NC_007427	GCT	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
115	NC_007427	CT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	0 %	50 %	76803378
116	NC_007427	GGCGAC	2	12	7540	7551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	76803378
117	NC_007427	CGA	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
118	NC_007427	CGG	2	6	7575	7580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803378
119	NC_007427	GTC	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
120	NC_007427	CGA	3	9	7608	7616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
121	NC_007427	ACT	2	6	7662	7667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803378
122	NC_007427	GAG	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803378
123	NC_007427	CTG	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
124	NC_007427	TGAC	2	8	8061	8068	25 %	25 %	25 %	25 %	76803378
125	NC_007427	CTT	2	6	8169	8174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803379
126	NC_007427	CGT	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803379
127	NC_007427	AAC	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803380
128	NC_007427	CGA	3	9	8997	9005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
129	NC_007427	TGC	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
130	NC_007427	CTT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803380
131	NC_007427	GAC	2	6	9049	9054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
132	NC_007427	TGAC	2	8	9074	9081	25 %	25 %	25 %	25 %	76803380
133	NC_007427	GCCC	2	8	9097	9104	0 %	0 %	25 %	75 %	76803380
134	NC_007427	ATC	2	6	9127	9132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803380
135	NC_007427	CTAC	2	8	9276	9283	25 %	25 %	0 %	50 %	76803380
136	NC_007427	CAA	2	6	9358	9363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803380
137	NC_007427	CGA	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
138	NC_007427	CCT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803380
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142	NC_007427	CTG	2	6	9587	9592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
143	NC_007427	TCG	2	6	9701	9706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
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156	NC_007427	AC	3	6	10385	10390	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
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244	NC_007427	CACG	2	8	15517	15524	25 %	0 %	25 %	50 %	76803384
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246	NC_007427	GAG	2	6	15588	15593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803384
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248	NC_007427	ATG	2	6	15645	15650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803384
249	NC_007427	TCAA	2	8	15723	15730	50 %	25 %	0 %	25 %	76803384
250	NC_007427	CAT	2	6	15803	15808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803384
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252	NC_007427	CTT	2	6	15873	15878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803385
253	NC_007427	GGAA	2	8	15905	15912	50 %	0 %	50 %	0 %	76803385
254	NC_007427	CCA	2	6	15959	15964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803385
255	NC_007427	GCA	2	6	15983	15988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803385
256	NC_007427	AAG	2	6	16016	16021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803385
257	NC_007427	GTA	2	6	16048	16053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803385
258	NC_007427	TCG	2	6	16119	16124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803385
259	NC_007427	ACC	2	6	16200	16205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803385
260	NC_007427	CGC	2	6	16245	16250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803385
261	NC_007427	CAG	2	6	16414	16419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803386
262	NC_007427	GA	4	8	16449	16456	50 %	0 %	50 %	0 %	76803386
263	NC_007427	CAT	2	6	16492	16497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803386
264	NC_007427	CAA	2	6	16533	16538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803386
265	NC_007427	CG	3	6	16630	16635	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
266	NC_007427	GCA	2	6	16655	16660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803386
267	NC_007427	TCA	2	6	16772	16777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803386
268	NC_007427	GC	3	6	16821	16826	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
269	NC_007427	TGC	2	6	16889	16894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803386
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271	NC_007427	GCC	2	6	16937	16942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803386
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273	NC_007427	TCA	2	6	17057	17062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803386
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276	NC_007427	GTT	2	6	17155	17160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803386
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289	NC_007427	TGT	2	6	18690	18695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803387
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382	NC_007427	GGCT	2	8	24796	24803	0 %	25 %	50 %	25 %	76803393
383	NC_007427	GAA	2	6	24842	24847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803393
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386	NC_007427	CCGA	2	8	24916	24923	25 %	0 %	25 %	50 %	76803394
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390	NC_007427	ATC	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803394
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